Cette église s'élevait au milieu du cimetière et fut baptisée église "Saint Rémy et Pantaléon". L'image de Saint Pantaléon ornait le maître-autel. C'était une église-mère pour les villages d'Allschwil, Hégenheim, Bourgfelden et une partie de Buschwiller. Pour s'y rendre, les fidèles de Buschwiller empruntaient la ruelle appelée maintenant, rue de la Scierie, et suivaient ensuite un chemin qui longeait le flanc de la colline du Rosenberg; on appelait cet itinéraire "Chilchawag".

Les nobles de Hégenheim
Dès le XII ème siècle, l'évêque de Bâle concéda le village de Hégenheim ainsi que le château de l'époque, aujourd'hui disparu, à une famille issue de la bourgeoisie bâloise.

L'une de ces familles prit le nom de "Von Hégenheim". Elle administra notre village de 1230 à 1451. En 1978 la municipalité de Hégenheim a adopté les armoiries de cette famille, ainsi définies: Coupé d'or et d'azur au pal de l'un dans l'autre.

Les nobles de Hégenheim eurent à faire face à de nombreux malheurs, car dès le XIIIème siècle, des luttes sanglantes commencèrent entre les Habsbourg et l'éveché de Bâle. A plusieurs reprises les Autrichiens ravagèrent les possessions de l'évêque de Bâle. Notre village et son église ne furent pas épargnés. De plus en 1349 une terrible épidémie de peste fit de nombreuses victimes aussi bien parmi les habitants que les animaux d'élevage. Quelques années plus tard, en 1356, un violent séisme endommagea toute la contrée. De nombreuses constructions furent détruites ou ébranlées.

A la fin de la guerre de Cent Ans, les écorcheurs conduits par le dauphin, futur roi Louis XI envahirent le territoire de l'évêché de Bâle et écrasèrent les confédérés et les bâlois à la bataille de Sankt Jakob en 1444. En se retirant en 1445 ils incendièrent le bourg de Hégenheim et le château.